L'ATAAI œuvre à la protection des milieux aquatiques et de l'ichtyofaune par l'analyse et le suivi des projets liés à ces lieux, des activités didactiques dans les écoles et des sessions de formation pour le public, de nouvelles recherches scientifiques et des campagnes de récupération de la faune piscicole.
En tant qu'éco-acteur, il collabore activement avec le Parco del Monviso et le Centre de recherche pour l'étude des rivières alpines (ALPSTREAM) et favorise la diffusion des connaissances sur la protection des milieux aquatiques et de leur faune.